Het etablissement bevindt zich in een van de delen van het viaduct van de High Line. De donkere gegalvaniseerde stalen gevel onthult een lage boog getrokken door een oranje gordijn - dit is de ingang van het restaurant. Het interieur wordt gedomineerd door het ruwe beton dat typerend is voor Ando-projecten, maar in dit geval wordt het verzacht door gordijnen van wit glasvezel die het plafond bedekken.
De sushibar en het hoofdrestaurant zijn gegroepeerd rond de trap die naar de bar op de benedenverdieping leidt. In het midden van de trap staat een installatie van 17.400 flessen gevuld met water, elk met een led.
Omdat de oorspronkelijke ruimte waarin het restaurant zich bevindt, werd gebruikt als laad- en losplatform, kostte het veel tijd en moeite om opnieuw op te bouwen, wat uiteindelijk 12 miljoen dollar kostte. Morimoto is eigendom van de beroemde restauranthouder Stephen Starr, wiens andere etablissementen zijn ontworpen door ontwerpers zoals Karim Rashid en David Rockwell.
Het restaurant is vernoemd naar de chef-kok, Masaharu Morimoto, die enorm populair is in de Verenigde Staten.