De Botín Stichting voor Kunst en Cultuur werd gebouwd in het voormalige havengebied, dat lange tijd de Atlantische Oceaan afsneed van het stadscentrum. De situatie is veranderd met het verschijnen van een nieuw cultureel centrum op de plek van een parkeerplaats voor de ferryterminal, maar de veranderingen ten goede zouden veel bescheidener zijn geweest als het niet voor het initiatief van het stadsbestuur was geweest: zij verborg een drukke snelweg (13 miljoen auto's per jaar) in een tunnel die tussen stadsblokken en een pier liep. Hierdoor konden de historische tuinen van Pereda worden uitgebreid tot aan de oceaan: het is op hun nieuwe grondgebied dat het Botín-centrum zich bevindt.
Het is boven de grond opgeheven op witte steunen en is gedeeltelijk bedekt met groen, om de integriteit van het zeegezicht dat vanaf dit punt opent niet te verstoren. Voor hetzelfde doel is het volume van het gebouw opgedeeld in twee "hemisferen", verbonden door passages en terrassen van glas en staal. Tegelijkertijd steekt het gebouw negen meter de Atlantische Oceaan in en vormt het een soort springplank.
De gevels zijn bekleed met 280.000 ronde parelmoer tegels die de gestroomlijnde vorm van het gebouw benadrukken. De uiteinden van de "hemisferen", met uitzicht op de oceaan en de stad, zijn van glas, volledig van glas - en het entreepaviljoen is de enige kamer op de begane grond in het midden. Er is een informatiecentrum, een museumwinkel, een café en een restaurant.
Daarboven, op het grotere, westelijke "halfrond", zijn twee verdiepingen met tentoonstellingshallen met een geavanceerd systeem voor het filteren van zonlicht in de plafonds, typisch voor de Renzo Piano Building Workshop-projecten.
Het oostelijke deel herbergt een zaal voor 300 toeschouwers en een educatief centrum. Op de westelijke gevel werd een ledscherm geplaatst en een amfitheater werd opgetrokken voor filmvertoningen en uitzendingen van wat er in het gebouw gebeurt.
Het nieuwe deel van de Pereda-tuinen is ontworpen door de landschapsarchitect Fernando Caruncho: tijdens de wederopbouw is de oppervlakte van dit stadspark gegroeid van 20.000 naar 48.000 m2, en het groen daar - van 7.003 naar 20.056 m2. Er werd daar een nieuw toeristisch informatiecentrum gebouwd, ook volgens het project van het pianobureau.