Het programma voor de restauratie van het schip en de oprichting van een museum eromheen, ontwikkeld door de fondsbeheerder van de klipper in samenwerking met de architect Nicholas Grimshaw, zou dit jaar worden afgerond. Maar in mei 2007 werd de Cutty Sark ernstig beschadigd door brand, dus de opening voor bezoekers wordt uitgesteld tot 2010. Tegelijkertijd wordt er verder gewerkt aan de restauratie van het schip en de creatie van een nieuwe museumstructuur eromheen. Het zou zijn romp aan kabels moeten hangen en ter hoogte van de waterlijn een glazen plafond moeten installeren dat het droogdok overlapt, waarin het schip sinds 1954 - toen het in Greenwich was aangemeerd - is gehuisvest. Zo zal onder de Cutty Sark een nieuwe tentoonstellingsruimte worden gecreëerd, die ook het hout van de klipperhuid zal beschermen: terwijl in het open dok het schip aanzienlijk werd beschadigd door rottende bacteriën en de metalen delen waren bedekt met roest.
De brand van vorig jaar vormde een ernstig obstakel voor de uitvoering van het project: hierdoor werd het programmabudget, dat 25 miljoen pond bedroeg, aanvankelijk met nog eens 10 miljoen verhoogd.
Maar dankzij een donatie van £ 3,3 miljoen van de Israëlische filantroop Sammi Ofer, die tijdens de Tweede Wereldoorlog in de Britse marine diende, zullen het schip en het museum in het voorjaar van 2010 worden heropend.
Ofer schonk ook £ 20 miljoen aan het National Maritime Museum in Greenwich voor de bouw van een nieuwe vleugel.
