Vanaf het allereerste begin van het ontwerp was de belangrijkste taak van de Spaanse architect om zijn gebouw in harmonie te brengen met de omgeving, voornamelijk met het museum, waarvoor Moneo leiderschap erkent, niet alleen in het Abandoibarra-gebied, maar ook in Bilbao als geheel. Ook het nieuwe park rondom beide gebouwen en de gebouwen van de Universiteit van Deusto, gelegen in de buurt, speelden een rol.
Om zijn gebouw van het museum te scheiden en er visuele conflicten mee te vermijden, koos Moneo voor de monolithische, kubische vorm van het gebouw en gebruikte hij glazen blokken als materiaal voor de gevels, die er bij daglicht vrij bescheiden uitzien - zeker in vergelijking met glanzend titanium. Tegelijkertijd draaide hij zich om in de richting van het Gehry-gebouw, de brede binnenplaats van zijn gebouw, gevormd door een nis (meer bepaald door de "uitgehaalde" hoek van het gebouw) met wanden van transparant glas. Er zijn leeszalen waardoor er een visuele verbinding ontstaat tussen het interieur van de bibliotheek en het museum. Ook is de binnenplaats bedoeld om te dienen als een overgangsruimte tussen het landschap van het park en de geometrie van de architectuur van Moneo. Maar 's nachts verandert de relatie tussen de twee structuren: het museum stort in duisternis en de bibliotheek gloeit van binnenuit.
Het nieuwe gebouw heeft 10 verdiepingen - vijf ondergronds, waar de boekenbewaarplaats zich bevindt, en vijf bovengronds, met leeszalen en auditoria: het is een feit dat dit meer is dan alleen een bibliotheek - het is een 'Resource Center for Study and Research.
