De hoofdtentoonstelling met als thema "Steden, architectuur en samenleving" wordt dit jaar gecombineerd met de tentoonstelling "Cities of Stone" in Venetië en de tentoonstelling "Port City" in Palermo.
Nieuw dit jaar is de uitreiking van de belangrijkste prijsuitreiking aan het einde van de Biënnale op 8 november 2006. Tegelijkertijd worden de laureaten van de Stone Lion-prijs - voornamelijk de Venetiaanse sectie en de Portus-architectuurprijs - in de sectie Palermo gehonoreerd. Op de openingsdag, 10 september, ontvangt alleen Richard Rogers de Gouden Leeuw voor zijn vitale bijdrage aan de ontwikkeling van architectuur …
De partner van de Biënnale dit jaar is Risanamento SpA, dat in Milaan nieuwe gebieden bouwt in Santa Giulia (architect Norman Foster) en de voormalige industriezone Falk (architect Renzo Piano). Ze presenteert haar tentoonstelling in Venetië gewijd aan deze projecten. De tentoonstelling wordt ook ondersteund door de bedrijven "Inarcassa" en "illycaffè". Het bedrijf Targetti heeft in samenwerking met de Biënnale een creatief verlichtingssysteem geïnstalleerd voor het Italiaanse paviljoen, enkele andere tentoonstellingsruimten in Venetië en alle tentoonstellingen in Palermo.
